mBio (2)

mBio 1: Le travail de Forquet et al. décrit de la première carte transcriptomique d'une espèce de Dickeya. Elle peut donc contribuer de manière significative à de nouveaux progrès dans le domaine de la phytopathogénicité. Il s'agit également de l'une des premières applications rapportées de l'analyse séquentielle native de l'ARN à longue lecture de Nanopore chez les procaryotes. Nos résultats donnent un aperçu des règles de base de la coordination de la transcription qui pourraient être valables pour d'autres bactéries et susciter un intérêt dans le domaine de la microbiologie en général. En particulier, nous démontrons que l'expression des gènes est coordonnée à l'échelle des unités de transcription plutôt qu'à celle des opérons, qui sont de plus grandes unités génomiques fonctionnelles capables de générer des transcrits avec une composition génétique variable pour un réglage fin de l'expression des gènes en réponse aux changements environnementaux. En accord avec des études récentes, nos résultats indiquent que le modèle de l'opéron canonique est insuffisant pour expliquer la complexité des transcriptomes bactériens.

https://journals.asm.org/doi/10.1128/mbio.00524-22

mBio 2: Le travail de Shiheng Zhang et du groupe de Vladimir Shevchik porte sur un groupe de bactérie pathogènes utilisant un systeme de secretion specifique (dit de type II) comme vecteur majeur de virulence. Les bactéries Gram-négatives possèdent deux membranes cellulaires prenant en sandwich un filet de peptidoglycane qui, ensemble, forment une enveloppe cellulaire protectrice robuste. Pour transférer les protéines effectrices à travers cette enveloppe multicouche, les bactéries ont développé plusieurs systèmes de sécrétion spécialisés. Dans le système de sécrétion de type 2 et dans certaines autres machineries bactériennes, les sécrétines forment de grands pores multimériques qui permettent le transport de protéines effectrices ou de filaments à travers la membrane externe. Les sécrétines sont essentielles pour l'acquisition de nutriments et la pathogénicité et constituent une cible pour le développement de nouveaux antibactériens. Le ciblage des sous-unités de sécrétine dans la membrane externe est souvent facilité par une classe spéciale de lipoprotéines appelées pilotines. Ils sont montré dans ce travail que chez D. dadantii et certaines autres bactéries, la protéine de scaffold GspB agit de concert avec la pilotine, facilitant l'assemblage du pore de la sécrétine et son ancrage à la fois à la membrane interne et à la paroi cellulaire bactérienne. Des homologues de GspB, de composition en domaines variées, sont présents dans de nombreux autres T2SS.

https://journals.asm.org/doi/10.1128/mbio.00253-22