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02 Nov
02/Nov/2022

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Des étudiants de l’INSA de Lyon et de l’Université Lyon 1 multirécompensés pour leur projet de recherche en Biologie à la compétition internationale iGEM

Le principe du concours :

L’équipe FIAT LUX, composée d’étudiants de l’INSA Lyon et de l’Université Claude Bernard Lyon 1, et supervisée par des enseignants-chercheurs et doctorant du laboratoire Microbiologie Adaptation et Pathogénie, a participé du 26 au 28 octobre 2022 au Parc des Expositions de Paris (porte de Versailles) à la grande finale de la compétition internationale de biologie de synthèse iGEM (International Genetically Engineered Machine competition). Cette compétition est organisée chaque année et a rassemblé en 2022, 370 équipes d’étudiants de plus de 40 pays différents, chaque équipe devant proposer une innovation en biotechnologie développée et réalisée lors de l’année précédant la compétition. L’iGEM est une compétition d’innovations en biotechnologie de très grande ampleur initialement créée par le Massachusetts Institute of Technology (MIT) en 2004. C’est la plus grande compétition étudiante de biologie au monde.

Le projet :

L'équipe INSA-Université Lyon 1 FIAT LUX a créé un nouvel outil de détection en temps réel de bactéries pathogènes de plantes en faisant produire de la lumière à ces bactéries. L'objectif est de pouvoir visualiser directement leur développement dans les plantes grâce à une simple caméra. L'équipe a également conçu un prototype d'incubation et d'acquisition d'images et un logiciel d'analyse d'images open source. C'est donc une solution globale, clé en mains, qui est proposée pour l'analyse de la propagation des bactéries pathogènes. Le projet a utilisé un instrument de plateforme de recherche de l'Univ. Lyon 1, l'imageur de luminescence NightShade.

Nos résultats lors du concours :

L’équipe FIAT LUX est l’équipe ayant été la plus récompensée de la compétition:

  • -  2e place générale du concours dans la catégorie undergraduate parmi +190 équipes du monde entier, et sélectionnés parmi les 7 meilleures équipes sur 370.

  • -  Élue meilleur projet dans le domaine de la nutrition et de l’alimentation parmi 28 équipes.

  • -  5 prix spéciaux parmi un total de 16 prix : meilleure présentation, meilleur wiki (site internet), meilleur hardware, meilleur assemblage d’ADN, meilleure vulgarisation et éducation.

  • -  4 nominations pour les prix suivants : meilleure éthique intégrée au projet, meilleur software, meilleure collection de pièces d’ADN et meilleur projet en développement durable.

  • -  Médaille d’or en reconnaissance de tous les critères iGEM validés par l’équipe.

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Un travail récompensé :

Il s’agit de plus d’un an de travail, en effet, l’équipe a été créée en Avril 2021. Avant d’aller présenter le projet final auprès de plus de 350 équipes, des juges et des invités de renommée, plusieurs étapes ont eu lieu. Tout d’abord, plusieurs mois de travail en laboratoire afin de créer notre outil FIATLUX, mais aussi des heures à créer le logiciel libre de droits qui servira à analyser la lumière émise par les bactéries pathogènes. De plus, un site internet conçu par l’équipe est disponible et recense plus d’une année de travail, tant au niveau scientifique que social ou écologique, servant de base à toute personne voulant en apprendre plus sur le sujet. Ce site internet est un élément clé dans l'évaluation du projet lors du concours.

Les membres de l’équipe FiatLux (construisez l'agriculture de demain):

  • Étudiants : Anaëlle ROMAN (INSA-Lyon), Basma MAKHLOUFI (INSA-Lyon), Cassie KOHUT (Université Lyon 1) , Elise PIETTE (INSA-Lyon), Guillaume FULCONIS (INSA-Lyon), Laia DARNE CLAVARON (INSA-Lyon), Léa LE LARGE (INSA-Lyon), Madeleine BOURSEUL (INSA-Lyon), Manon AUBERT (INSA-Lyon), Marianne RICHAUD (INSA-Lyon), Marine AURRAND (INSA-Lyon), Mathilde CECCHI (INSA-Lyon), Solène FAVIER (INSA-Lyon), Théo MATHIEU (INSA-Lyon), Tom ROBLIN (INSA-Lyon).

  • Superviseurs : Agnès RODRIGUE (Maître de conférences INSA-Lyon, laboratoire MAP) et Erwan GUEGUEN (Maître de conférences Université Lyon 1, laboratoire MAP)

  • Encadrants: Typhaine Brual (Doctorante INSA de Lyon, laboratoire MAP), Marianne Chouteau (Enseignante-Chercheuse INSA-Lyon, Directrice adjointe du laboratoire S2HEP), Marie-Pierre Escudié, Marion Létisse (Maître de conférence INSA-Lyon), Makram Mghezzi-Habellah.

  • Sponsors financiers principaux:

    • inov3PT, BioMérieux, Université Claude Bernard Lyon 1

  • Autres sponsors:

    • Kubii, SnapGene, BioRender, Expleo Group, Assystem, Promega France, Integrated DNA Technologies, Twist Bioscience, GenScript, New England Biolabs, Fondation INSA, ABIL Biosciences INSA Lyon, Crous Lyon.

  • Soutien institutionnel:

    • INSA de Lyon, Université Claude Bernard Lyon 1, Laboratoire MAP UMR5240, Fédération de Recherche BioEEnViS (Symbiotron pour l'imageur Nightshade).

Remerciements: 

BayerCropScience, INSA Lyon DÉPARTEMENT BIOSCIENCES. Auriane Vicente, Calvin Dutreve, Davyd Chaumard et Yvann Frangville.

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