Impact des procyanidines, inhibiteurs de la dénitrification biologique, sur la microflore des plantes

Il a été démontré que certains métabolites secondaires de plantes, comme les procyanidines, induisent une inhibition biologique de la dénitrification rendant ainsi le nitrate disponible pour la croissance des plantes ce qui se traduit par un gain de biomasse végétale. Le présent travail a évalué si les procyanidines avaient un impact sur la richesse et la diversité des communautés microbiennes, impliquées dans la fertilité du sol et les services écosystémiques. Des plants de laitue ont été cultivés dans deux sols contrastés tant au niveau de leur texture que de leur physico-chimie, et ce, avec et sans amendement en procyanidines. La diversité microbienne a été évaluée en utilisant le séquençage Illumina des gènes ARNr 16S procaryotes et des régions ITS fongiques. Nous avons utilisé une méthode d’inférence fonctionnelle pour évaluer les fonctions microbiennes putatives présentes dans les deux sols et reconstruit le réseau d'interactions microbiennes. Nous avons montré que l'amendement en procyanidines n'affecte pas la diversité et l'activité putative des communautés microbiennes. En revanche, les interactions microbiennes diffèrent selon l'amendement en procyanidines.