Activités
Le lac Dziani Dzaha, un laboratoire naturel témoin d’un monde vivant perdu
Mylène Hugoni et les membres de l'équipe M2E du laboratoire MAP décrivent dans leur dernier article, paru ce mois-ci dans Microbiomes, l'écophysiologie des Archées extrémophiles et non cultivables du groupe des Woesearchaeota dans un environnement naturel : le lac Dziani Dzaha de l'archipel des Comores à Mayotte.
En combinant des approches métagénomiques et métatranscriptomiques, les auteurs ont cherché premièrement à résoudre la phylogénie des Woesearchaeota et à déterminer l'origine et la diversité de ces Archées halophiles et alcaliphiles. Deuxièmement, ils ont étudié le répertoire génomique des Woesearchaeota pour déchiffrer leur succès écologique à travers les forts gradients d'oxygène et de soufre de cet écosystème modèle. Puis, ils ont testé si les activités transcriptomiques in situ pouvaient soutenir les inférences métaboliques basées sur la génomique et si leurs activités variaient selon les niches écologiques spécifiques du système.
Leurs résultats révèlent des comportements différents en fonction des groupes phylogénétiques de Woesearchaeota, remettant en cause les préceptes actuels d’un mode de vie unique à toutes les Woesearchaeota. Cette découverte remarquable démontre un degré de complexité inattendu chez ces archées, qui pourrait refléter une perception avancée de leur environnement, avec des stratégies écologiques différentes selon les conditions environnementales.
Article :
Lineage-dependent partitioning of activities in chemoclines defines Woesearchaeota ecotypes in an extreme aquatic ecosystem. Cloarec LA, Bacchetta T, Bruto M, Leboulanger C, Grossi V, Brochier-Armanet C, Flandrois JP, Zurmely A, Bernard C, Troussellier M, Agogué H, Ader M, Oger-Desfeux C, Oger PM, Vigneron A, Hugoni M. Microbiome. 2024 Nov 29;12(1):249. doi: 10.1186/s40168-024-01956-0.
Communiqué de Presse de l'Université Lyon 1
Microbiome du lac Dziani Dzaha
microscopie électronique à balayage réalisé au CTµ Lyon (UCBL) - © Florence Ruaudel