Chromatine et Régulation de la Pathogénie bactérienne
L’objectif de l’équipe CRP est de développer un modèle intégratif de la régulation génétique bactérienne en prenant comme modèle une bactérie phytopathogène. La régulation rapide et précise de l’expression des gènes, en réponse aux signaux intracellulaires ou environnementaux, repose sur des programmes génétiques complexes et robustes, dont l’exécution nécessite une modulation fine de la synthèse et de la dégradation des ARN et des protéines. Nous étudions en particulier le lien entre la dynamique du chromosome (organisation spatiale, topologie de l’ADN, distribution des protéines associées au nucléoïde) et la régulation génétique.
Trois axes sont explorés par des approches transdisciplinaires :
- Axe 1 : Dynamique de la chromatine et expression des gènes
- Axe 2 : Réseaux de régulation transcriptionnels et assemblage de complexes nucléoprotéiques
- Axe 3 : ARN non-codants
Les méthodes utilisées vont de la génétique moléculaire, la transcriptomique, l’imagerie in vivo et in vitro, à la modélisation de biophysique et de biologie computationnelle en privilégiant une vision multi-échelles.