M2E Recrute
Comme chaque année l'éauipe M2E recrute des étudiants de master 2.
Les sujets prioritaires pour l'équipe cette année sont listés ci-dessous.
N'hésitez pas à nous contacter si vous êtes passonnés par les autres axes de recherche de l'équipe.
Déterminants génétiques de l’adaptation des Woesearchaeota à l’hypersalinité
Dans le cadre de ce stage de Master 2, nous nous intéresserons aux déterminants génétiques de l’adaptation des Woesearchaeota à l’hypersalinité et à leur expression. Il s’agira de collecter dans les bases de données un nombre suffisant de génomes de Woesearchaeota de qualité et de mettre en regard leur distribution écologique afin d’identifier les clades halophiles. La comparaison des caractéristiques génomiques (taille des génomes, %GC, nombre d’ORF, point isoélectrique, ratio en acides aminés R/K, contenu en gènes, etc.) des lignées halophiles versus non halophiles permettra de déterminer s’il existe des signatures génomiques / gènes caractéristiques de l’halophilie chez les Woesearchaeota. Par des approches couplant reconstruction de séquences ancestrales et phylogénie moléculaires, nous retracerons l’histoire évolutive des gènes identifiés.
Ce stage se déroulera à l’interface des équipes Adaptation aux Environnements Extrêmes du laboratoire MAP (UMR 5240) et l’équipe Bioinformatique, Phylogénie et Génomique Évolutive du LBBE (UMR 5558).
Il est encadré par Mylène Hugoni (MAP) et Céline Brochier-Armanet (LBBE)
Sélection et caractérisation de microorganismes et d’enzymes pour la dégradation de polluants persistants
Les composés organohalogénés (COH) (ex : chlordécone, PFAS, ...) font partie des nombreux produits chimiques largement utilisés depuis plus d'un siècle dans les secteurs agricoles, militaire, et en santé publique. Ces composés sont très persistants dans l'environnement et ont été classés comme polluants organiques persistants (POPS) par la convention de Stockholm en 2001.
L'équipe travaille sur la mise au point de solution biotechnologiques de décontamination de ces polluants.
Le but du stage sera de sélectionner des populations capables de croître sur source de carbone halogénés, de caractériser leur capacité de déhalogénation et de réaliser et cribler des banques issues de ces populations afin d’identifier les gènes codant pour les déhalogénases recherchées.
Ce stage sera encadré par Sonia MION et Yoann LOUIS (MAP)
Pas chez nous mais presque…
Dans le cadre de l'ANR MetHalo coordonnée par l'équipe M2E, nos collègues de l'ICBMS (INSA Lyon) recherchent un.e personne pour réaliser la synthèse des produits de dégradation de la chlordécone, un composé perchloré utilisé massivement dans les bananeraies pour lutter contre le charançon du bananier.
Ce stage est encadré par
Dr. Maïwenn Jacolot & Pr. Florence Popowycz
UMR CNRS 5246, ICBMS - INSA Lyon, UCBL, CNRS, CPE
The main aim of this work is to bring into culture a novel group of Archaea which has no cultured representative to date. Isolate and characterize the diversity of Archaea in lake Dziani Dzaha. The characterization of Archaea will include a complete physiological and phenotypical in order to allow the description of these new archeal species. The initial duration of the position is 24 months, with the possibilty to apply to european funding (MSCA) if eligible.